Інститут стоматології функціонує в складі Національної академії медичних наук і має багату історію, нерозривно пов'язану з розвитком вітчизняної стоматології та щелепно-лицевої хірургії. З моменту свого створення в 1928 році він є головною установою країни з проблем стоматології, координуючи наукову діяльність, що проводиться в наукових, навчальних і лікувальних установах країни.
